運行形態

亀岡本線

平日日中運行本数

区間	上り	下り
鵜ノ川駅―湯之花温泉駅	4本/時	4本/時
計	4本/時	4本/時

平日ラッシュ時運行本数

区間	上り	下り
鵜ノ川駅―湯之花温泉駅	4本/時	4本/時
鵜ノ川駅―稗田野駅	2本/時	2本/時
計	6本/時	6本/時

亀岡本線は全列車が各駅停車で運転されており、優等列車の設定はありません。
車両は基本的に2両編成と1両編成が混在して運用されていますが、土日・祝日・年末年始・お盆や、紅葉シーズン、温泉街においてイベントが行われる際には全列車が2両編成となります。
原則として全列車ワンマン運転となっています。

千代川線

平日日中運行本数

区間	上り	下り
亀電亀岡駅―亀電千代川駅	3本/時	3本/時
計	3本/時	3本/時

平日ラッシュ時運行本数

区間	上り	下り
亀電亀岡駅―亀電千代川駅	6本/時	6本/時
計	6本/時	6本/時

ラッシュ時と日中で運行本数が大きく異なっているのが特徴です。
これはこの路線の利用客の半数近くが大井工業団地への通勤客や、周辺の学校への通学客であるためにこのようになっています。
車両は日中は2両編成と1両編成が混在して運用され、ラッシュ時は全列車2両編成となります。
原則として全列車ワンマン運転となっています。